如果特許人與被特許人不僅簽訂了特許經(jīng)營合同，還與被特許人簽訂了商標(biāo)使用許可合同，那么就需要由特許人在三個月內(nèi)憑商標(biāo)使用許可合同到商標(biāo)局備案，而且特許人需要監(jiān)督被特許人使用該商標(biāo)的商品質(zhì)量。如果特許人未予備案，法律并未規(guī)定特許人會因此受到行政處罰，特許人與被特許人簽訂的商標(biāo)使用許可合同也并不必然無效，但是，該商標(biāo)使用許可合同不得對抗善意第三人，也就是說，因為該商標(biāo)許可并沒有向公眾公示，善意第三人無法通過正常渠道得知這一許可，因而該許可合同對任何善意第三人均不產(chǎn)生法律效力。

但是，如果特許人與被特許人僅僅只是通過特許經(jīng)營合同體現(xiàn)了商標(biāo)的授權(quán)使用，由于該特許經(jīng)營合同不是一個單純的商標(biāo)使用許可，還包含了除商標(biāo)使用許可以外的其他很多類似于經(jīng)營資源的允許使用、技術(shù)和服務(wù)的持續(xù)支持等內(nèi)容，因此特許經(jīng)營合同是無法作為商標(biāo)使用許可合同辦理備案的，同時也完全沒有為了備案而備案的必要。